В романе рассказывается о людях, попавших в результате крушения воздушного шара на необитаемый остров. Используя знания и практический опыт, потерпевшие крушение принимаются за работу и неустанным трудом создают свое благополучие.

"Таинственный остров" - последняя часть трилогии, на страницах которой читатель вновь встретится с героями романа "Дети капитана Гранта", а также узнает тайну капитана Немо, не разгаданную профессором Аронаксом в романе "Двадцать тысяч лье под водой".